RNA测序-方法学说明
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2017年3月27日
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F&Q
GCBI使用的常见F&Q
其明技术专家
Q：注册为GCBI用户时收不到验证码？ A：请查看每个输入框或者按钮下方的文字提示，请确保每个信息填写正确与错误提示，并且图形验证码已填写。若不是以上情况请联系客服（400-690-3323） Q：豌豆是什么意思？GC…
RNA测序-方法学说明
概述 GCBI使用目前最新最高效的转录组分析流程（HISAT2+STRINGTIE+BALLGOWN），使用HISAT2方法将测序原始的fastq文件比对到Ensembl数据库中，根据STRINGTIE方法对序列进行组装和定量，得到…
测序Demo数据说明
一、全基因组测序Demo样本 GCBI平台为用户提供了5个全基因组测序的Demo数据，其中4个来源于云健康公司，1个来源于GCBI。 1.云健康样本 样本名称 分组 检测方 测序平台 测序深度 GCAS-Case-Demo1 Cas…
使用「VCF」文件做测序分析
名词解释 「*.vcf」文件：是指测序所得".fastq"文件进行简单处理所得的文件格式的后缀，该文件主要包含突变位点数据等。GCBI目前可以支持：".fastq.gz"、".fastq"和".vcf"文件。 测序分析 —— 使用"…
方案设计指南
样本列表： 对实验分组匹配样本，并设置显示名称和选择分子类型(mRNA、miRNA、lncRNA)。1. 样本组名避免重复。2. 设置分组时，系统默认第一组是实验组。 差异筛选： 通过选择(Q值/差异倍数、差异数量)和设置差异参数，…