一、全基因组测序Demo样本
GCBI平台为用户提供了5个全基因组测序的Demo数据,其中4个来源于云健康公司,1个来源于GCBI。
1.云健康样本
样本名称 | 分组 | 检测方 | 测序平台 | 测序深度 |
GCAS-Case-Demo1 | Case | 云健康 | Hiseq X ten | 30X |
GCAS-Case-Demo2 | Case | 云健康 | Hiseq X ten | 30X |
GCAS-Control-Demo3 | Control | 云健康 | Hiseq X ten | 30X |
GCAS-Control-Demo4 | Control | 云健康 | Hiseq X ten | 30X |
2.GCBI标准品
样本名称 | 检测方 | 测序分析 | 测序深度 | 样本信息 |
GCSAS-standard-sample | 明码生物 | Hiseq X ten | 30X | 标准品编号:NA12878D 性别:女 来源:coriell institute,NIGMS人类遗传学细胞库 细胞类型:B淋巴细胞 样本类型:血液 样本来源:外周静脉血 种族:白人 来源国家:美国 |
二、外显子组测序Demo样本
样本名称 | 分组 | 捕获试剂盒 | 组织类型 | 平台 | 来源 | 测序深度 |
GCSAS-WES-Case-Demo1 | Case | S03723314-SureSelect Human All Exon V4 | prostate cancer | Illumina HiSeq 2000 | SRR2185681 | 300X |
GCSAS-WES-Case-Demo2 | Case | S03723314-SureSelect Human All Exon V4 | prostate cancer | Illumina HiSeq 2000 | SRR2185679 | 300X |
GCSAS-WES-Case-Demo3 | Case | S03723314-SureSelect Human All Exon V4 | prostate cancer | Illumina HiSeq 2000 | SRR2185746 | 300X |
GCSAS-WES-Case-Demo4 | Case | S03723314-SureSelect Human All Exon V4 | prostate cancer | Illumina HiSeq 2000 | SRR2185747 | 300X |
GCSAS-WES-Control-Demo5 | Control | S03723314-SureSelect Human All Exon V4 | Normal prostate | Illumina HiSeq 2000 | SRR2185742 | 300X |
GCSAS-WES-Control-Demo6 | Control | S03723314-SureSelect Human All Exon V4 | Normal prostate | Illumina HiSeq 2000 | SRR2185748 | 300X |
GCSAS-WES-Control-Demo7 | Control | S03723314-SureSelect Human All Exon V4 | Normal prostate | Illumina HiSeq 2000 | SRR2185791 | 300X |
GCSAS-WES-Control-Demo8 | Control | S03723314-SureSelect Human All Exon V4 | Normal prostate | Illumina HiSeq 2000 | SRR2185712 | 300X |
本文由 GCBI学院 作者:其明技术专家 发表,转载请注明来源!