F&Q

测序Demo数据说明

一、全基因组测序Demo样本

GCBI平台为用户提供了5个全基因组测序的Demo数据,其中4个来源于云健康公司,1个来源于GCBI。

1.云健康样本

样本名称 分组 检测方 测序平台 测序深度
GCAS-Case-Demo1 Case 云健康 Hiseq X ten 30X
GCAS-Case-Demo2 Case 云健康 Hiseq X ten 30X
GCAS-Control-Demo3 Control 云健康 Hiseq X ten 30X
GCAS-Control-Demo4 Control 云健康 Hiseq X ten 30X

2.GCBI标准品

样本名称 检测方 测序分析 测序深度 样本信息
GCSAS-standard-sample 明码生物 Hiseq X ten 30X 标准品编号:NA12878D
性别:女
来源:coriell institute,NIGMS人类遗传学细胞库
细胞类型:B淋巴细胞
样本类型:血液
样本来源:外周静脉血
种族:白人
来源国家:美国

二、外显子组测序Demo样本

样本名称 分组 捕获试剂盒 组织类型 平台 来源 测序深度
GCSAS-WES-Case-Demo1 Case S03723314-SureSelect Human All Exon V4 prostate cancer Illumina HiSeq 2000 SRR2185681 300X
GCSAS-WES-Case-Demo2 Case S03723314-SureSelect Human All Exon V4 prostate cancer Illumina HiSeq 2000 SRR2185679 300X
GCSAS-WES-Case-Demo3 Case S03723314-SureSelect Human All Exon V4 prostate cancer Illumina HiSeq 2000 SRR2185746 300X
GCSAS-WES-Case-Demo4 Case S03723314-SureSelect Human All Exon V4 prostate cancer Illumina HiSeq 2000 SRR2185747 300X
GCSAS-WES-Control-Demo5 Control S03723314-SureSelect Human All Exon V4 Normal prostate Illumina HiSeq 2000 SRR2185742 300X
GCSAS-WES-Control-Demo6 Control S03723314-SureSelect Human All Exon V4 Normal prostate Illumina HiSeq 2000 SRR2185748 300X
GCSAS-WES-Control-Demo7 Control S03723314-SureSelect Human All Exon V4 Normal prostate Illumina HiSeq 2000 SRR2185791 300X
GCSAS-WES-Control-Demo8 Control S03723314-SureSelect Human All Exon V4 Normal prostate Illumina HiSeq 2000 SRR2185712 300X
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本文由 GCBI学院 作者:乞嘚咙咚呛咚呛 发表,转载请注明来源!

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