基础科研

三点轻松搞定GEO数据上传

三点轻松搞定GEO数据上传

做芯片或测序相关实验,发表文章有时需将数据上传至GEO,获得相应的ID号。那如何上传呢?今天小编在这里给大家整理了一份操作指南。GEO简介GEO,Gene Expression Omnibus的简称,是NCBI旗下的一个分支数据库,…
芯片Meta分析,菜鸟进阶第一步

芯片Meta分析,菜鸟进阶第一步

Meta分析作为发文章的一种捷径, 虽然显得有些功利,但在缺乏时间开展新的实验或是没有能力开展大规模的临床实验时不失为一种好方法。 创新从模仿开始,今天我们以一篇meta分析文章为例,来看看表达谱meta分析的基本思路。 Meta分…
共表达网络分析教程

共表达网络分析教程

分子生物网络展现了分子之间的相互作用,可较为深入地反映基因间的表达调控关系,在组学机理的研究中尤为重要。今天我们首先来看看共表达网络分析。共表达网络分析基因共表达网络分析(Gene Co-expression Network Ana…
教你如何做趋势分析

教你如何做趋势分析

在实验的设计中,我们经常需要了解基因随时间,温度,药物浓度等变化的表达趋势。当生物体按照一定顺序发生变化或者受到外界环境刺激(如受到不同浓度的化学药物诱导)时,基因表达变化也会呈现趋势特征。 趋势分析趋势分析(STC, Series…
如何用Path-net来筛选核心通路

如何用Path-net来筛选核心通路

上次介绍了如何用基因功能(GO)和信号通路(Pathway)分析来缩小差异基因范围。那如何筛选出核心Pathway呢?信号通路是一个相互作用网络,核心Pathway主导了疾病变化过程,是影响其他信号通路的枢纽。找到核心Pathway…
1分钟看懂差异基因结果

1分钟看懂差异基因结果

想研究某现象的分子机制,老板豪气的来一句,先测个转录组吧,看下差异表达基因。是否在心里窃喜,制个样就完事了,太easy有木有。等大堆数据回来的时候,是不是傻眼了?从何下手挑选差异表达基因呢?今天就来聊聊测序实验中最基础的一步如何挑选…
如何分分钟get权威文献

如何分分钟get权威文献

一入科研深似海,从此周末是路人。文献检索作为必备的技能之一,米那桑是否已升至满级。文献海海,如何快速找到the exact one,最相关,最新,最权威呢。下面简单介绍几招。从PubMed到GoPubMedPubMed 海量的文献数…