数据库说明
未分类
2019年10月14日
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MAS系统
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肿瘤评级说明
未分类 2019年10月14日 1
BED文件格式说明
其明技术专家
由于各类的BED文件形式非常多，无法统一识别，故定义了系统支持的BED样式。如下图所示： 注： 1.bed共3列，第一例染色体位置，第二列start，第三列end。 2.bed开头不可有说明内容。 3.bed的染色体位置必须是chr…
添加项目
添加项目是在“项目管理”页面“添加按钮”进行添加。 添加项目主要分为4个步骤完成。分别为： 1、基本信息：项目的必要信息填写。 2、患者信息：患者的适应症相关信息填写。 3、其他信息：样本的附属信息填写，若对应的检测项目无配置，则可…
数据结果表操作说明
数据结果表主要针对Snpindel，CNV，SV数据结果表的可操作部分的说明。用户可以基于表中的评级和注释信息来获取位点相关信息，判断是否需要发送至报告。简要操作步骤为： 1、查看位点数据。 2、判断需要报告的位点。 3、填写完对应…
报告编辑说明
每个检测试剂盒对应的报告模板都是基于定制化制作，所以各个报告模板均不相同。报告编辑简单的流程为3步： 1、勾选项目点击编辑报告按钮进入编辑页面。 2、编辑报告中的文本字段并保存。 3、点击完成报告发送报告内容。 所有相关按钮说明： …
上传文件
文件上传的位置位于“文件管理”页面，点击“文件上传”按钮进入页面。完成上传仅需3步： Step1项目选择：选择已经建立的检测项目名称。注：样本文件不可以跨检测项目使用。 Step2上传文件：系统选择文件弹窗，选择需要上传的文件，支持…
新手上路
介绍 MAS云系统实现了分子数据与数据分析的统一化管理，通过对分子病理检测平台产生的数据进行标准化处理、解析、分析、形成可用于病理报告撰写的数据格式，最后将这些数据有效地积累形成医院自身的分子病理数据库，使得每个检测平台的数据可以在…
数据库说明
MAS系统使用的数据库主要用于位点和基因的注释，可以基于基因的弹窗和结果表中的注释获得，以下为注释相关的数据库： 数据库名称 目前使用的注释层面 网址 CancerHotspots snpindel http://cancerhot…
质控说明
MAS系统中项目的质控全部可以基于“质控查看”按钮进行查看。 质控的结果值全是基于BAM计算获得，目前本系统提供的质控信息如下表所示： （注：若有需要不在下表内的质控，请于相关销售人员沟通。） 质控名称 质控说明 PF bases …
遗传评级说明
MAS系统遗传评级根据ACMG指南，使用五级分类标准“致病的”（class5）、“可能致病的”（class4）、“意义不明确的” （class3）、“可能良性的”（class2）和“良性的”（class1）。 表格中的遗传评级列展示…
证据评分说明
证据评分功能是一款基于用户输入的疾病和表型来对基因进行评分的软件，基于得分和结果为用户提供对于结果筛选，位点评判和解读的辅助帮助。 证据评分会基于检测结果中的每条基因与样本的适应症信息进入数据库检索获得结果数据并进行评分，共分为4步…