芯片数据分析

数据集获取与上传

数据集获取与上传

在GCBI的分析实验室进行芯片数据分析需要有芯片的CEL文件才可以进行实验室的使用。 GCBI的分析实验室支持的芯片类型有:GCBI支持分析的芯片类型 用户可以获得芯片CEL的途径有: 1.检测对应芯片的自有CEL文件。 2.基于N…
网络分析结果说明

网络分析结果说明

一个基因的表达受到其他基因的影响,而这个基因又影响了其他基因的表达,这种相互影响相互制约的关系构成了复杂的基因表达调控网络。更一般些,几乎所有的细胞活动都会被基因网络控制。生命是存储并加工信息的复杂系统,单纯的去研究某一个基因并不能…
网络分析使用说明

网络分析使用说明

GCBI网络分析支持pathway Relation Network、gene Signal Network、gene-Coexpression-Network、lncRNA-Gene-Network、miRNA-Gene-Netw…
功能和通路分析使用说明

功能和通路分析使用说明

GO涉及的基因和基因产物词汇分为三大类,涵盖生物学的三个方面:生物过程、细胞组分、分子功能。生物过程(biological process)指由一个或多个分子功能有序组合而产生的系列事件;在做差异筛选的时候一般是选择生物过程,因为生…
差异基因分析使用说明

差异基因分析使用说明

方案设计 在方案设计页面,拖动“差异分析”模块到方案编辑板,对两个样本分组到差异分析模块之间进行连线。   参数设置 实验室&对照组设置:根据右侧显示调整,比较结果是实验组vs对照组。 Q值设置:Q值默认为0.05…
GCBI支持分析的芯片类型

GCBI支持分析的芯片类型

GCBI平台目前只支持Affymetrix公司基因芯片的原始数据(CEL格式文件,例:Exp1_(HTA-2_0).CEL),一共有20个平台的芯片可以分析,具体列表如下: 实验平台 芯片类型 物种 分子类型 GPL570 [HG-…
示范实验室使用说明

示范实验室使用说明

方案介绍 为了方便新手用户使用实验室,我们归纳了近几年分析项目的规律,提供了一些设计好的分析方案,这些方案几乎涵盖了所有的研究思路。这里是示范实验室的方案简介。如果对于设计方案思路不是很了解,可以参考示范实验室的方案,直接复制方案到…
分析模块的应用

分析模块的应用

GCBI在线实验室芯片方案中,为用户提供了8个模块,用户可以根据自己的分析目的,利用这些模块排列组合,形成个性化的分析方案。下面我们来介绍一下每个模块的应用。 模块具体应用方法 第一步:拖动样本分组模块至中间设计区域(至少拖动两个样…
操作流程介绍

操作流程介绍

GCBI实验室可以在线进行基因芯片的数据分析(GCBI支持分析的芯片类型),在GCBI,您只需要一杯咖啡的时间就可以完成以往半个月才能完成的分析,在GCBI实验室,不需要R也不需要perl,不需要cluster和cytoscape,…