测序数据分析
GO/Pathway 数据筛选
其明技术专家
GO功能分析 一、显著性筛选 显著性P值 采用Fisher精确检验，对功能分析结果的显著性判断，一般选择P<0.05的功能为具有显著统计学意义的功能。 显著性FDR值 为了控制多重比较检验中犯第一类错误的整体概率，我们通过Be…
RNA测序-数据筛选
概述 根据数据分析的结果，GCBI提供从差异、疾病和自定义3个方面对基因/转录本进行筛选，详情如下。 差异筛选 显著性P值 差异的显著性判断，一般认为P<0.05时，差异具有统计性意义。GCBI使用…
测序数据上传
测序分析须知 1、目前GCBI平台上支持的测序分析数据包括：物种为人的全基因组，全外显子，靶向捕获测序，转录组测序。 2、在开始准备分析之前，您需要准备一块大于300GB储存以上的移动硬盘用来存储分析数据和分析结果，为了保证数据传输…
DNA测序-注释库列表
序号 数据库 简介 1 NCBI数据库中dbSNP子库 dbSNP（版本：v144）收录了所有物种中发现的短序列多态和突变信息，包括单核苷酸多态（SNP）、微卫星、小片段插入/删除多态等定位、侧翼序列和功能、频率信息…
DNA测序-方法学说明
概述 测序的原始数据(raw_data)为fastq格式的压缩文件(*.fq.gz)，为了得到较为可靠准确的变异分析结果，我们参考了当前的一些主流分析软件与方法(如文献[1,2]等)，实施了一套基于比对、去重、过滤为基础的认证变异(…
DNA测序-数据筛选
概述 根据数据分析和数据库的注释信息，GCBI提供从差异分析，变异对蛋白功能的影响，疾病，人群和自定义5个方面对变异位点进行筛选，详情如下。 差异筛选 显著性P值 根据变异位点在不同样本中的基因型差异，利用Fisher精确检验，找到…
序数据上传
测序分析须知 1、目前GCBI平台上支持的测序分析数据包括：物种为人的全基因组，全外显子和靶向捕获测序。 2、在开始准备分析之前，您需要准备一块大于300GB储存以上的移动硬盘用来存储分析数据和分析结果，为了保证数据传输速度请尽量选…
测序产品说明
人类全基因组测序 人类外显子组测序 人类靶向捕获测序 分析模块： 1） 单样本变异位点的筛选 2） case/control差异变异位点分析 3） 交集和扣除 4） 差异，蛋白功能，疾病，人群多方向的数据筛选 分析模块： 1） 单样…
新手上路
第一步：登录并进入实验室 登录 进入GCBI主页面。输入网址https://www.gcbi.com.cn/gcuser进入GCBI会员登陆页面。输入用户名和密码登陆，如果没有注册，可以点击右上角“立即注册”。 进入实验室 登陆后点…