方法&工具
如何简单三步完成一篇SCI？
乞嘚咙咚呛咚呛
简单三步搞定一篇paper，小编你确定不是在逗我？ 哪次发paper之前，不得经过导师循（bu）循（duan）善（cui）诱（can）、实验室里没日没夜做实验，还得苦逼的自学这自学那（分析要学、统计要学……）。小编你是故意来diss…
大家都是怎么找转录因子的？
这次更新基因雷达上线了一个新功能——转录因子预测。调控机制目测可以出个下篇了，想要看上篇的戳这里，重点讲的是怎么找目标基因的上下游基因。 转录因子预测 功能和名字一样直白，就是预测基因可能的转录因子。使用也延续基因雷达…
大数据下的肿瘤基因突变和表达特异性
作者：成东林 肿瘤是一种由DNA变异不断累积而导致细胞发生不受控激增并形成新生物的遗传疾病。肿瘤基因组学是基因组学中的一门子学科,它主要通过高通量测序技术来将特定基因和肿瘤关联起来。肿瘤基因组学的主要目的是通过鉴定新的原癌基因或者抑…
关于SNP，你需要了解的
作者：weiqian 1、SNP如何影响蛋白结构与功能？ 上世纪50年，”中心法则“阐明DNA的改变会导致RNA变化，并最终可能导致编码氨基酸的变化。而氨基酸改变（蛋白质一级结构）可能会导致蛋白质高级结构改变并最终影响蛋白质的功能。…
如何做出你想要的富集分析图
作者：赵文静 GSEA是一个可下载后免费使用的全基因组表达谱芯片数据分析工具。它根据已有的对基因的定位、性质、功能、生物学意义等知识的基础上，首先构建了一个分子标签数据库，数据库中包含了多个功能基因集。通过分析一组处于两个生物学状态…
如何高效找疾病致病SNP位点
文献检索引擎有多少？尽管有那么多文献检索平台，可在这一环依然费时费力。 举个具体的例子，比如你想找肺癌的相关基因，第一反应是什么？查看下肺癌相关文献，看看前人的研究结果。就算有筛选“含基因的文献”这个功能，还是有N多篇…
如何快速查看一个基因在各个肿瘤中的表达情况
数据挖掘除了基因之间的定性关系，若想进行更深层面的研究，还是得落到原始数据上去。但找原始数据，还要整理，简直生无可恋。 表达雷达 今天介绍一个小工具-表达雷达，可查看基因在各个肿瘤中的表达概况，这么多的信息，感觉想咋用…
零基础也可以做RNA-seq差异分析
基因表达谱的差异分析是RNA-seq中最常见的应用。你眼中的RNA-seq差异分析或许是酱紫的，对不会编程，不懂统计，纯正生物学出生的人， 内心简直SOS …… 但有些人眼中的RNA-seq差异分析却是这样的，借助云平台和图形化界面…
一键获取基因的TF，miRNA、lncRNA及上下游基因调控网络
在做基因研究的时候，有时是不是苦于寻找其上下游调控基因，TF，miRNA等。数个数据库，N篇文献来回翻，才能辛辛苦苦拼起一张基因调控网络图。今天介绍个小工具——调控雷达，一键就可查实现查看某个基因的调控网络，内容涵盖其上下游调控基因…
如何知道一个基因与哪些疾病有关？
如何知道一个基因与哪些疾病相关?一篇篇文献翻阅？太out啦。一个小工具即可搞定。疾病雷达，利用Mesh数据库中的疾病分类，从Pubmed数据库对基因在疾病中被报道的次数进行挖掘，绘制了基因报道次数最多的前20种疾病的柱状图，其反映了…