小张聊科研 的所有文章

数据库挖掘,你只知道GEO和TCGA就out了!

数据库挖掘,你只知道GEO和TCGA就out了!

公开的数据库是一个宝藏,大家喜欢从挖掘数据库,要么从中寻找思路和研究的分子,要么直接发表文章,关于TCGA和GEO这两个数据库,大家已经知道了。 当然,除了GEO和TCGA外,这种公开的数据库还有很多,GEO收录的信息包括了RNA表…
不做实验SCI论文发发发系列之——PPI网络

不做实验SCI论文发发发系列之——PPI网络

  网络关系常常用于揭示一些复杂的作用关系,在基因调控关系中也是非常常见的。在SCI论文中一张漂亮的网络图往往能提升整个文章的逼格,在之前的文章中也介绍过不少网络图的作图,大家可以在公众号内搜索关键词“生信”翻看以前的文章…
不懂R,怎么分析GEO的数据(1)?

不懂R,怎么分析GEO的数据(1)?

GEO(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/)是个非常强大的数据库,收录的信息包括了各个疾病、各个实验条件下的数据,既有mRNA表达、蛋白表达、非编码RNA表达的结果,又有SNP、DNA甲基化的结果: …
CNS离我们太远,但5分的离我们很近

CNS离我们太远,但5分的离我们很近

世界上的人如果分成两类,那么可能有千万分之一的是天才,其余的都是普通人。CNS上的文章也包括两类,分别是极少数顶尖的研究工作;大量的“普通”研究工作。其中,大量的普通研究工作是指研究者众多,最终被接收仅此一两家的研究结果。梦熊看到一…
写meta分析文章前,先了解下什么是二次研究吧!

写meta分析文章前,先了解下什么是二次研究吧!

所谓二次研究,顾名思义就是在已有研究基础上进行的再加工,包括非系统研究(也就是我们常说的文献综述)和系统综述。两者的区别在于:传统的文献综述往往涉及的是某一类(而不只是某一个)临床问题;文献检索策略模糊,可重复性差;文献选择具有主观…
1~5分SCI,如何优雅地发发发

1~5分SCI,如何优雅地发发发

昨晚有个粉丝找我抱怨,跟师兄说,他老板最近刚拿到了一个新的项目,钱虽然不多但35万是有的,导师让他省着点花,让他毕业时发2篇至少5分的文章,这里面还包括劳务费、差旅费等杂费,满打满算剩个30万算是好的了,30万发两篇5分的?作为初级…
这些好习惯能让做科研的你受益终身!

这些好习惯能让做科研的你受益终身!

习惯是个可怕的东西,它可以决定很多事,一旦养成却难改至极。好的习惯可以帮你省时省力,事半功倍,而坏的习惯会让你画地为牢,事倍功半。在科研道路上,多养成一些好习惯,能让学习工作轻松不少。今天就跟大家分享一些本宫认为比较有用的好习惯。详…
TCGA数据库的数据怎么查?(一)

TCGA数据库的数据怎么查?(一)

现在做生物信息学分析发SCI文章非常火,我们检索了下这两年5分以上的杂志发表数据挖掘为主的文章已经有不下80篇了,其中Oncotarget占了不少,这些文章主要以GEO和TCGA数据库中的数据挖掘为主,分析工具包括了Cbioport…