费雷塞斯 的所有文章

标准TCGA大文章需要哪些数据?

标准TCGA大文章需要哪些数据?

很多人总是问我如何挖掘TCGA的数据,发文章! 可是他却连TCGA的数据是怎么来的都不知道,TCGA发了几十篇CNS大文章(自己测序的)了,每篇文章都有几百个左右的癌症样本的6种数据,这几年凑成了一万多个样本,都放在GDC里面可以根…
如何机智、高效选择投稿杂志

如何机智、高效选择投稿杂志

在上周的SCI线下讨论课上,有小伙伴提到,文章辛辛苦苦写好后,如何知道自己的文章可以去投哪些杂志。高效率的目标杂志选择是文章最终被接收的前提,时常有小伙伴发个截图给我说文章杯具了,然而好些都是因为不合适其杂志被拒的。网上有很多方法帮…
干货|CircRNA 预测软件之find_circ使用流程(二)

干货|CircRNA 预测软件之find_circ使用流程(二)

在前面的文章中我们讨论了目前研究火热的环状RNA预测软件,通过对同一个样本采用RNAse R+/-两种建库方式,我们比较了5种常用环状RNA预测软件精确度和敏感度。在今天的推文里,我将重点选取find_circ进行详细介绍。 Fin…
CircRNA预测软件大对比(一)

CircRNA预测软件大对比(一)

近年来,环状RNA(circRNA)成为新兴的明星分子,越来越多的环状RNA被发现参与众多的病例生理过程。随着高通量测序技术的日益成熟,基于测序reads的环状RNA预测方法成为人们讨论的热点。来自于丹麦奥尔胡斯大学(Aarhus …
推荐|TCGA数据下载工具

推荐|TCGA数据下载工具

1、TCGA简介美国政府发起的癌症和肿瘤基因图谱(Cancer Genome Atlas,TCGA)计划,试图通过应用基因组分析技术,特别是采用大规模的基因组测序,将人类全部癌症(近期目标为50种包括亚型在内的肿瘤)的基因组变异图谱…
如何利用百度Google高级搜索

如何利用百度Google高级搜索

本讲要介绍的两个高级搜索指令: 【filetype:pdf】 --限定搜索结果的格式为pdf。 --也可选用其他格式,比如doc,ppt等。 --注意中间的冒号:是英文的。 【site:www.fda.gov】 --限定在www.f…
三分钟教你做出使用TCGA数据发表文章中的图表

三分钟教你做出使用TCGA数据发表文章中的图表

TCGA是目前最大的癌症基因信息数据库,通过TCGA不仅可以验证你的实验结果,还可以寻找新的研究方向,围绕TCGA已经有很多重量级文章出现,对它的使用愈发重要。目前使用的方法有两种,一是利用一些在线工具进行检索和查询,例如cBioP…