其明技术专家 的所有文章
教你如何做趋势分析
其明技术专家
在实验的设计中，我们经常需要了解基因随时间，温度，药物浓度等变化的表达趋势。当生物体按照一定顺序发生变化或者受到外界环境刺激（如受到不同浓度的化学药物诱导）时，基因表达变化也会呈现趋势特征。 趋势分析趋势分析(STC, Series…
如何用Path-net来筛选核心通路
上次介绍了如何用基因功能（GO）和信号通路（Pathway）分析来缩小差异基因范围。那如何筛选出核心Pathway呢？信号通路是一个相互作用网络，核心Pathway主导了疾病变化过程，是影响其他信号通路的枢纽。找到核心Pathway…
1分钟看懂差异基因结果
想研究某现象的分子机制，老板豪气的来一句，先测个转录组吧，看下差异表达基因。是否在心里窃喜，制个样就完事了，太easy有木有。等大堆数据回来的时候，是不是傻眼了？从何下手挑选差异表达基因呢？今天就来聊聊测序实验中最基础的一步如何挑选…
如何分分钟get权威文献
一入科研深似海，从此周末是路人。文献检索作为必备的技能之一，米那桑是否已升至满级。文献海海，如何快速找到the exact one，最相关，最新，最权威呢。下面简单介绍几招。从PubMed到GoPubMedPubMed 海量的文献数…
如何寻找课题方向
在科研的道路上，似乎每一步都显得十分不易，从课题方向的选择，实验的实施，到最后文章的撰写。今天我们就来聊聊第一步，课题方向的选择问题。 课题决定了研究高度，有时是不是在课题方向上不知从何下手？对此，在这给大家支简单的两招。 第一招 …
案例解析ceRNA研究思路
在之前我们分别介绍了研究mRNA，miRNA，lncRNA的实验思路，在各自成文后，还能否进行联合分析从中挖掘和发现更多有意思的东西呢？ 这就是今天要介绍的ceRNA调控分析。 ceRNA定义 ceRNA（competing end…
讲篇怎么用10个GEO数据集翻牌1个基因的Oncotarget!
MARCKS contributes to stromal cancer-associated fibroblast activation and facilitates ovarian cancer metastasis PMID…
乳腺上皮细胞Pten和p53联合缺失与依赖eEF2K促进三阴性乳腺癌
推荐理由 1.文中分析了Pten-p53突变乳腺癌细胞基因的表达情况，以及使用GSEA方法分析基因参与的信号通路找到与癌症相关的信号通路AKT等，以及找到eEF2K在Pten-p53突变中的影响和作用方式。2.文中提到了GSEA分…
轻松发4.5分SCI，你也可以
今天看到一个新闻，说青岛大学教授郁金泰博士在8年不到的时间里发表了232篇论文，在近连续三年中平均每5.3天发表一篇论文。小编不仅被震惊到了，而且深受打击……发文章到底有没有捷径？肯定有，不然每5.3天一篇是什么概念。郁博士的成就应…
一文掌握基因功能（GO）和信号通路（Pathway）分析
上次1分钟系列介绍了差异基因结果解读，那如何从众多差异基因中筛选出目标基因呢?下面小编以一篇文章为例，来看看如何缩小差异基因范围，使目标基因挑选更有针对性。 文章案例Identification of a novel biomark…