如何快速查看一个基因在各个肿瘤中的表达情况

数据挖掘除了基因之间的定性关系，若想进行更深层面的研究，还是得落到原始数据上去。但找原始数据，还要整理，简直生无可恋。

表达雷达

今天介绍一个小工具-表达雷达，可查看基因在各个肿瘤中的表达概况，这么多的信息，感觉想咋用咋用。看文献找到一个感兴趣的基因，可以用它看看在某些肿瘤中是否差异表达；自己有数据，可以用它做参考来筛差异基因；若是做肿瘤间差异的，表达雷达就是素材。还有一个万能的地方非常之合适，那就是文章中的讨论部分，讨论一下××基因在不同肿瘤间的一个表达概况，由此得出……

表达雷达

表达雷达怎么用

说了那么多，怎么用表达雷达呢？五个字，非常之简单。举个小例子，还是上次看文献看到的CCL5，其被证实和乳腺癌的转移有关，那它在其他肿瘤中的表达情况如何呢？是否和其他癌症的转移也有关系？

在基因雷达中输入CCL5，查看表达概况，可看到CCL5在各个癌症中的表达值，红色为癌组织，蓝色为正常组织，左右两边为癌症的缩写。选择感兴趣的癌症，下方会有详细的说明，样本表达的平均值，最大值，最小值，样本数，标准差等等。

可以看到CCL5在一些癌症中都高表达，如SARC肉瘤，KIRC肾癌，HNSC头颈鳞状细胞癌，并在淋巴样肿瘤弥漫性大B细胞淋巴瘤表达值最高。CCL5在乳腺癌中高表达，并且其和乳腺癌转移有关，那CCL5在SARC肉瘤，KIRC肾癌中表达差异倍数都比乳腺癌高，那是否也会和癌症转移相关呢？接下来就可以看看CCL5在这些癌症转移中是否被研究过，没有的话恭喜你，所以课题没有思路时，可以多瞅瞅表达雷达。

拓展

看到一个感兴趣的基因，想研究，怎样才能最快的找到一个课题方向？或者说脑子里已经有一个好的idea了，怎样才能高效的判断是否已经被别人捷足先登了呢？（说白了就是看这个基因的研究概况O__O"…，这不是重点好么）

还是借用上面的CCL5，先在基因雷达中看下CCL5的科研热点，知己知彼，方能运筹帷幄。输入CCL5，有关的文献研究，疾病，miRNA等研究概况都一一展现。

在Pubmed中可看到CCL5的研究概况，若想更聚焦，可点击疾病看到CCL5在各个疾病中的研究概况。

还要聚焦的话，可点击miRNA查看和CCL5相关的每个miRNA，每个都附有文献支持。

想怎么切入，就看你自己的了

表达雷达的数据来自哪？如何整合出来的？看这里