乳腺上皮细胞Pten和p53联合缺失与依赖eEF2K促进三阴性乳腺癌
推荐理由
1.文中分析了Pten-p53突变乳腺癌细胞基因的表达情况，以及使用GSEA方法分析基因参与的信号通路找到与癌症相关的信号通路AKT等，以及找到eEF2K在Pten-p53突变中的影响和作用方式。
2.文中提到了GSEA分析的方法，是否可以用其他算法进行分析，以及找到MMTV-Cre小鼠中不同的突变方式（Pten和p53）产生的基因变化。
乳腺癌中抑癌基因Pten和p53经常缺失，但两者联合失活的影响并不太清楚。这里，研究者展示了通过WAP-Cre小鼠乳腺特异性缺失Pten，靶向肺泡上皮细胞，引起癌细胞潜伏期缩短，与之相比，MMTV-Cre同样引起癌细胞潜伏期缩短，靶向basal/luminal细胞。Pten-p53联合突变促进claudin-low，三阴性乳腺癌（TNBC）形成，呈现AKT信号通路激活，更多呈现与Pten或p53单独突变相关的间充质干细胞特性。24个基因有显著性差异在WAP-Cre:Pten/p53和MMTV-Cre:Pten/p53两者之间，以此来预测claudin-low病人低生存率。蛋白激酶分析明确真核伸长因子2激酶（eEF2K）抑制剂比PI3K/AKT/mTOR抑制剂在人和小鼠Pten/p53缺失的TNBC细胞系中更有效。eEF2K抑制剂敏感性与AKT通路活性有关。eEF2K单一治疗抑制Pten/p53缺失TNBC异质性，和阿霉素一起可有效的杀死癌细胞。研究结果明确了claudin-low病人预测特征，提供了使用eEF2K抑制剂通过AKT通路治疗TNBC依据。
芯片类型：GPL6246 [MoGene-1_0-st] Affymetrix Mouse Gene 1.0 ST Array [transcript (gene) version]
分组信息：
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Sample
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MMTV-Neu
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MMTV-Cre:p53
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MMTV-Cre:PTEN
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MMTV-Cre:PTENp53
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WAP-Cre:PTEN
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WAP-Cre:PTENp53
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Mouse Gene 1.0 ST
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3
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6
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9
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8
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9
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7
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1.使用SAM算法（GCBI）比较WAP-Cre:Pten/p53和MMTV-Cre:Pten/p53之间不同，以及找到差异基因参与的功能和信号通路以及基因的相互作用网络（Signal-Net）
2.分析MMTV-Cre小鼠中不同的突变方式（Pten和p53）产生的基因变化，以及导致不同细胞表型的分子机制。
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