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乳腺上皮细胞Pten和p53联合缺失与依赖eEF2K促进三阴性乳腺癌

推荐理由

 
1.文中分析了Pten-p53突变乳腺癌细胞基因的表达情况,以及使用GSEA方法分析基因参与的信号通路找到与癌症相关的信号通路AKT等,以及找到eEF2K在Pten-p53突变中的影响和作用方式。
2.文中提到了GSEA分析的方法,是否可以用其他算法进行分析,以及找到MMTV-Cre小鼠中不同的突变方式(Pten和p53)产生的基因变化。
 
文献信息
 
Combined deletion of Pten and p53 in mammary epithelium accelerates triple-negative breast cancer with dependency on eEF2K

PMID: 25330770

影响因子:  8.665

 
主要内容:
   乳腺癌中抑癌基因Pten和p53经常缺失,但两者联合失活的影响并不太清楚。这里,研究者展示了通过WAP-Cre小鼠乳腺特异性缺失Pten,靶向肺泡上皮细胞,引起癌细胞潜伏期缩短,与之相比,MMTV-Cre同样引起癌细胞潜伏期缩短,靶向basal/luminal细胞。Pten-p53联合突变促进claudin-low,三阴性乳腺癌(TNBC)形成,呈现AKT信号通路激活,更多呈现与Pten或p53单独突变相关的间充质干细胞特性。24个基因有显著性差异在WAP-Cre:Pten/p53和MMTV-Cre:Pten/p53两者之间,以此来预测claudin-low病人低生存率。蛋白激酶分析明确真核伸长因子2激酶(eEF2K)抑制剂比PI3K/AKT/mTOR抑制剂在人和小鼠Pten/p53缺失的TNBC细胞系中更有效。eEF2K抑制剂敏感性与AKT通路活性有关。eEF2K单一治疗抑制Pten/p53缺失TNBC异质性,和阿霉素一起可有效的杀死癌细胞。研究结果明确了claudin-low病人预测特征,提供了使用eEF2K抑制剂通过AKT通路治疗TNBC依据。
 
样本信息

 
芯片类型:GPL6246 [MoGene-1_0-st] Affymetrix Mouse Gene 1.0 ST Array [transcript (gene) version]
样本数量:42个
GEO编号:GSE39955

物种:小鼠

分组信息:

 

Sample

MMTV-Neu

MMTV-Cre:p53

MMTV-Cre:PTEN

MMTV-Cre:PTENp53

WAP-Cre:PTEN

WAP-Cre:PTENp53

Mouse Gene 1.0 ST

3

6

9

8

9

7

 
数据复用方案

 
1.使用SAM算法(GCBI)比较WAP-Cre:Pten/p53和MMTV-Cre:Pten/p53之间不同,以及找到差异基因参与的功能和信号通路以及基因的相互作用网络(Signal-Net)

 
2.分析MMTV-Cre小鼠中不同的突变方式(Pten和p53)产生的基因变化,以及导致不同细胞表型的分子机制。

需要查看方案运行结果,请到实验室联系服务顾问,申请加入乳腺癌联盟实验室

 

 

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本文由 GCBI学院 作者:乞嘚咙咚呛咚呛 发表,转载请注明来源!

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