GO涉及的基因和基因产物词汇分为三大类，涵盖生物学的三个方面：生物过程、细胞组分、分子功能。生物过程(biological process)指由一个或多个分子功能有序组合而产生的系列事件;在做差异筛选的时候一般是选择生物过程，因为生物过程给出的信息比较多，对于差异基因的选择来说，它能提供更多的信息。

KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)是系统分析基因(及其编码产物)间关系、基因功能、基因组信息的数据库，它有助于研究者把基因及表达 信息作为一个整体网络进行研究。

参数设置

点击编辑板中的“功能和通路分析模块”，在右侧进行参数设置，功能分析选择“GO分析”，可以继续设置分析类型，FDR值和P值，网站默认值：P<0.05且FDR<0.05。

通路分析选择“pathway分析”，然后设置P值，网站默认值：P<0.05

GO分析结果

在结果导航里选择GO分析结果，GO的分析结果包括富集分析图、显著性分析图、显著性GO列表。

在结果的右侧可以进行功能的筛选，根据显著性排序，P值和关键字进行筛选，得到目标结果。

富集分析图：

显著性分析图：

显著性GO 列表：

pathway分析结果

在结果导航里选择pathway分析结果，pathway的分析结果包括显著性分析图、显著性pathway列表。

在结果的右侧可以进行功能的筛选，根据显著性排序，P值和关键字进行筛选，得到目标结果。

显著性分析图：

显著性pathway 列表：