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差异基因分析使用说明

方案设计

在方案设计页面,拖动“差异分析”模块到方案编辑板,对两个样本分组到差异分析模块之间进行连线。

 

参数设置

实验室&对照组设置:根据右侧显示调整,比较结果是实验组vs对照组。

Q值设置:Q值默认为0.05,推荐使用网站默认值。

注:Q值越高,筛选出差异基因越多,Q大于0.25得到的差异基因没有意义。

差异倍数设置:推荐使用网站默认值。

注:差异倍数越大,获得的差异基因越少。

根据样本情况,选择是否为配对比较。

 

分析结果

分析完成后进入方案,点击右上角的查看结果,进入结果页面,再点击左上角的“结果导航”,选择“差异基因”模块。这里差异分析结果有火山图、聚类图、差异基因列表。

 

差异火山图(Volcano Plot):

在火山图中显示了两个重要的指标(Fold change/p-Value),可以非常直观且合理地筛选出在两样本间发生差异表达的基因。

聚类图:

注:结果展示聚类图中,横坐标代表了分组间的样本名称,纵坐标代表了差异基因,因为差异基因过多,图中没有显示基因名称,图中红色代表差异基因在分组样本中表达值高,绿色代表差异基因在分组样本中表达值低。

差异基因列表:

本文由 GCBI学院 作者:乞嘚咙咚呛咚呛 发表,转载请注明来源!

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