数据库介绍之Bio-GPS、GEO和GCBI

Bio-GPS

Bio-GPS是一个免费的统筹和查询基因注释的新资源，其基因注释包含了公共资源的信息及诺华研究部门所生成的数据， 并具有开放的插件界面和自定义用户界面。用户可以根据大部分公共符号或accession number来寻找基因能够自定义页面，以突出显示最常用的资源。网站界面图如下:

那这个网站和其他数据库对比优势在哪呢？在芯片、新一代测序等实验中，如何去了解发现的一些候选基因？在BioGPS中，可以在一个程序和界面下呈现各个分散数据库的数据资源，不需要再一个个分门别类去查询。如在BioGPS中查找关于乳腺癌的基因FOXM1，查询结果如下图

GEO

NCBI旗下的GEO（gene expression omnibus）是一个基因表达数据仓库和在线资源，用于从任何物种或人造的来源检索基因表达数据。输入关键词和GEO Assension即可查到相关样本信息。

附：三步搞定GEO数据上传

GCBI

在GCBI平台，在样本中查询输入关键词也可链接到GEO数据库，并可直接发送到GCBI实验室进行再次分析。