数据库说明 其明技术专家 MAS系统, 帮助中心, 辅助功能说明 2019年10月14日 4.79K 0 1 MAS系统使用的数据库主要用于位点和基因的注释,可以基于基因的弹窗和结果表中的注释获得,以下为注释相关的数据库: 数据库名称 目前使用的注释层面 网址 CancerHotspots snpindel http://cancerhotspots.org/#/home CBMDB snpindel https://www.cancergenomeinterpreter.org/ CIViC snpindel https://civicdb.org/home clinvar snpindel https://www.ncbi.nlm.nih.gov/clinvar/ cosmic snpindel,sv https://cancer.sanger.ac.uk/cosmic/ dbnsfp snpindel http://varianttools.sourceforge.net/Annotation/DbNSFP dbscsnv snpindel http://asia.ensembl.org/info/docs/tools/vep/script/vep_plugins.html#plugins_existing dbsnp snpindel https://www.ncbi.nlm.nih.gov/snp/ DDD sv https://www.ddduk.org/ DGV sv http://dgv.tcag.ca/dgv/app/home Ensembl_Gene snpindel http://grch37.ensembl.org/index.html esp6500 snpindel http://evs.gs.washington.edu/EVS/ exac snpindel http://exac.broadinstitute.org/ g1000 snpindel,cnv,sv https://www.internationalgenome.org/ gnomad snpindel http://gnomad.broadinstitute.org/ GO snpindel http://geneontology.org/ HGMD snpindel http://www.hgmd.cf.ac.uk/ac/introduction.php?lang=english HPO snpindel https://hpo.jax.org/ ICGC snpindel https://icgc.org/ KEGG snpindel https://www.kegg.jp/ OMIM snpindel,sv https://omim.org/ oncoKB snpindel,cnv,sv http://oncokb.org/ refGene snpindel https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term= snpeff snpindel http://snpeff.sourceforge.net/ TCGA snpindel https://www.cancer.gov/about-nci/organization/ccg/research/structural-genomics/tcga TSGene snpindel https://bioinfo.uth.edu/TSGene/index.html 分享到微信 打开微信“扫一扫”,打开网页后点击屏幕右上角分享按钮 分享到微博 保存至印象笔记 本文由 GCBI学院 作者:其明技术专家 发表,转载请注明来源!