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中国的科研工作者都在关注哪些基因?

GCBI基因雷达为中国科研用户提供一键式基因检索服务,图形化展示基因多维度数据信息,物种主要为人,小鼠,大鼠。

提供的信息主要包括基因的介绍,其转录本信息,功能信息,参与的信号通路,靶向该基因的所有miRNA列表,相关疾病的信息,已有的SNP突变位点信息,基因组浏览图,相关的文献以及该基因的转录因子预测等,帮助我们更加立体、全面地了解基因。

基因雷达自上线以来受到广大科研工作者的喜爱,每年有300万人次的搜索。小编整理了九月在基因雷达中搜索量最高的前10个基因,分享出来,帮助大家了解中国的科研工作者都在关注哪些基因。

第三列对应的是该基因相关的pubmed相关文献数量。可以看出中国的科研用户即紧跟潮流、关注当前研究的热门基因,又针对自身研究情况、关注一些比较冷门的基因。

之前,我们讨论过最热门基因TP53 的研究情况,详情请戳链接:热个便当的时间,我就确定了一个基因值不值得研究。

但10个基因一一展示太繁琐,小编直接把网站和教程给大家,大家可以自己去感受一下用基因雷达来了解一个基因有多方便。

网址:https://www.gcbi.com.cn/gcanalyze/html/generadar/index

教程:https://mp.weixin.qq.com/s/9lADBqZ4Ku2raSZOwmHuHg

划重点!!小编今天要讲的是一个好玩的功能——多基因雷达。就小编一个人才发现基因雷达其实是可以分“单基因雷达”和“多基因雷达”进行搜索的?

 

多基因雷达是做什么的?

每个基因都存在着许多层面的关系。多基因雷达通过对各个数据库的整合和梳理来反应多个基因见不同层面的信息。

简单点来说,就是你怀疑那几个基因可能有关系,直接丢进去搜索一下就知道了,再也不用一个一个文献查!

比如说,刚刚发布的基因雷达搜索top10基因,他们之间有没有什么关系呢?直接丢进去试试看

▲图片来源于GCBI网站截图

点击搜索,这10个基因之间的关系就出来了

▲图片来源于GCBI网站截图

可以看出在“多基因疾病雷达图”中,显示了包含输入基因最多的前20种疾病,而Neoplasms与carcinogenesis与10个基因均相关,点击柱形图可以在下方的表中查看疾病富集度和包含基因的统计信息。

点击“核心网络”可以查看输入的基因间的相互作用关系,更便捷地了解输入基因的核心基因,我们可以发现这10个基因之间…并没有很大的关联。

▲图片来源于GCBI网站截图

黄色:代表连接数最多的基因,点击可以查看其与其他基因的对应关系与数据来源(图上所有基因均可点击查看)。

点击“关联网络”,可以查看与输入基因2种以上关系的相关基因,以及其与输入基因的相关关系。(最多只展示前100个与输入基因连接最多的关联基因)

▲图片来源于GCBI网站截图

蓝色:代表输入基因

黄色:代表连接数最多的基因

其他颜色:代表输入基因与连接基因的相互作用关系

输入基因与连接基因的关系数目越多,点越大,上图可以看出,EGFR基因的关系数目最多,点击可以在下表中查看其与其他基因的对应关系和数据来源(来源同样可点击查看)。

想研究输入基因相关的miRNA?点击“相关miRNA”可以查看与输入基因有2种以上作用关系的miRNA,以及他们之间的关系与数据来源。

▲图片来源于GCBI网站截图

点击“相关转录因子”可以查看与输入基因有2种以上作用关系的转录因子,以及他们之间的相互作用关系与数据来源。

▲图片来源于GCBI网站截图

以上可以看出,TOP10基因之间的直接作用关系(核心网络)虽然不是特别多,但他们的间接作用关系(关联网络、相关miRNA、相关转录因子)比较多。

▲图片来源于giphy.com

小编是闲得无聊试验功能而已,但!你就不一样了!

  • 老板给你一堆基因让你挑选研究?多基因雷达试一下
  • 发文章时想研究多个基因提高分数,怎么挑基因?多基因雷达试一下
  • 查文献遇到有关联的基因,想知道它们的作用关系?多基因雷达试一下!
  • ▪▪▪▪▪▪

一键了解多个基因之间的关系,老板再也不用担心我的学习!

你还有什么 “多基因雷达”的新玩法?快去试一下!

▲图片来源于soogif.com

 

会议预告

上海其明将携GCBI-MAS云平台参加中华医学会病理学分会第二十四次学术会议暨第八届中国病理年会。

欢迎大家共同参与此次会议,使会议增光添彩!

2018年10月11日-14日

成都世纪城国际会展中心

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本文由 GCBI学院 作者:乞嘚咙咚呛咚呛 发表,转载请注明来源!

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