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发三分文章,这个期刊加这个套路就够了,更有“+”分心得!

想发文章?你不只要有实力,还要有好多小技巧,比如说挑选一个比较好投的期刊。

小编这里就给大家推荐一个期刊——《Journal of Cellular Biochemistry》。

先看一下逃不开的影响因子,下面是这个杂志近10年的影响因子变化情况,常年稳定在3分左右,去年掉到了2.959,对于一些需要3分才能毕业的同学不太友好。

不过,它也有它的优势,不要版面费(一听这个都觉得超开心),审稿周期适中,大约3-5个月,杂志编辑和评审专家都比较负责任,一些投过的同学表示:编辑评审认真负责,建议中肯,对自己提升很大。

对3分要求不是特别敏感的小伙伴可以关注一下,并且它的自引率只有3.8%,17年中国人文章占期刊总数26%,投稿命中率48%,还算不错,明年分数很有可能涨上去。

咱们说完期刊说套路,一般5分以下的文章套路都非常明显,方便借鉴。小编这就从那个期刊里找了这么一个简单好用、方便借鉴的套路给大家“差异miRNA—靶分子通路—qRT-PCR验证”,算是完整的一套流程。

由于测序分析和验证都可以交给专业的科研服务公司,因此,这个套路对于没有时间做实验的小伙伴简直不要太友好。

里面选择的是miRNA,其作为biomarker的研究是一种经典思路,大家可以根据自己研究的疾病来借鉴。

只需要确认研究方向,然后取样交给科研服务公司,接下来就是坐等数据写文章啦!

下面就以发表在这个期刊的一篇文章为例讲讲这个套路(给你讲个小秘密:这篇文章的实验有我们公司的参与哦~)

研究思路

作者使用二代测序技术在PCOS(多囊卵巢综合征)/HA(雄激素过多症)女性患者与正常女性患者卵泡液中找到有显著差异的263个miRNA(>2-fold up-regulated or <0.5-fold down-regulated, p<0.05)。已有文献报道其中7种miRNA与PCOS/HA相关。

根据263个miRNA预测到31770个靶基因,对其进行GO功能富集和KEGG pathway分析发现这些靶基因有参与PCOS/HA。

研究结果

1.PCOS与对照组的临床特征型

通过分析本研究中PCOS和对照参与者的特征,我们发现这两组在年龄,雌二醇(E2)水平,PRL(催乳素)水平,体重指数(BMI)和FSH(卵泡刺激素)水平等方面没有差异。

然而,PCOS女性的血清睾酮(T)浓度和黄体生成素(LH)水平显著升高(p <0.05)。

2.寻找差异表达的miRNA

对PCOS与对照组卵泡液样本进行miRNA深度测序,共发现6659个差异miRNA,筛选出263个显著差异的miRNA(>2-fold up-regulated or <0.5-fold down-regulated, p < 0.05)。已有文献报道其中有6个miRNA(200a-3p、10b-3p, 200b-3p,29c-3p, 99a-3p and 125a-5p)显著上调,有1个miRNA(miR-105-3p in PCOS)显著下调。根据263个miRNA做聚类分析和火山图(如下图)

 

图1 聚类分析与火山图

3.验证差异表达的miRNA

qRT-PCR结果显示,上面提到的7个已被报道过的miRNA的表达水平与miRNA测序结果一致,进一步证实了测序结果的可靠性。

图2 qRT-PCR验证

4.靶基因的预测与功能分类

根据263个miRNA预测到31770个靶基因,使用GO分析和KEGG pathway分析发现这些靶基因与PCOS中的HA相关, miRNA参与PCOS中的细胞组分(图3 A)、分子功能(图3 B)、生物学功能(图3 C)、细胞组分(图3 D)的调节

图3 GO分析和Pathway分析

这篇文章就是典型的“差异miRNA—靶分子—通路—qRT-PCR”做biomarker的套路,基本就是3分上下的水平,想要更高分数也可以在本文的基础上进阶。小编分析比较了其他文献,给大家总结了这么几个进阶方法给大家参考。

分数进阶心得

  1. 在样本上下功夫,选择稀缺样本,增大样本量,使文章的结论更有信服力

此文中选择的卵泡液样本就比较少见。但是,此文的样本量只有3个患病加3个正常,可以增大样本量,表明研究的准确性;也可以挑选两个(甚至多个)miRNA,研究它们的相互作用。

  1. 结合热点,没有很深的机制研究也可以发高分。

比如说,选择外泌体来源的miRNA进行研究。所有的细胞都会分泌外泌体,培养之后分离外泌体就可以,所以外泌体的热点比较好蹭。

  1. 在生物信息分析上下功夫,也可以往更深处进行挖掘。

本文中的生信分析比较基础,如果可以做更深层次的分析,比如咱们之前讲过的高级生信分析系列,分数提高是非常轻松的。

  1. 进一步研究miRNA的作用机制,使研究更为完整。

文中只进行了靶基因的预测和GO、Pathway分析,接下来其实可以进行靶基因的验证,进一步探索作用机制,丰富文章的内容。

  1. 确认研究的miRNA可以作为biomarker对疾病进行判断,增加应用价值。

本文中找出了潜在的可作为biomarker的miRNA,但是没有进一步进行临床验证。如果能与传统临床手段进行比较一致,那么文章的重要性就很明显了。

本文由 GCBI学院 作者:乞嘚咙咚呛咚呛 发表,转载请注明来源!

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