meta分析

教大家如何做一篇meta-2

上篇:教大家如何做一篇meta-1

第六步:海选基因多态性(三原则)

6.1配对原则--拿来主义,从别人发的snpmeta中找基因,与我关心的疾病配对(从meta分析到基因突变)

6.1.1  基因多态性

在pubmed中检索《基因多态性》的检索式(重要的事情说三遍,这是第二遍)

在下面窗口输入哦。。。

6.1.2  meta分析

在pubmed中检索《meta分析》的检索式(重要的事情说三遍,这是第二遍)

6.1.3 将6.1中的snp 和6.2中的meta用AND连接起来

为什么要用AND?

让我们告诉你,通关密语:

“You AND Me,(From one world,)We are family”。

我和你,来自不同的“国度”,“AND”在一起。如果是自己--“wo”家里的,请“OR”在一起。

总结一句话:我和你,AND一起; “我wo”家里,OR一起。很好记哦,有没有。。。

 

 

 

 

最后在这233955文章中找自己感兴趣的gene,然后列成一个表并分类整理,整理好如下图所示:

6.1.4 找到自己关心的疾病,然后配对找原始研究

 

6.2 从点突变开始寻找(从基因突变到meta分析)

6.2.1 点突变和癌症,找到2376文章,然后筛选基因哦

例如,下面这篇就有很多与化疗反应有关的基因多态性。。。

Langer R,2005,Association of pretherapeutic expression of chemotherapy-related genes with response to neoadjuvantchemotherapy in Barrett carcinoma;Clin Cancer Res. 2005 Oct 15;11(20):7462-9. PMID:27128842   (文中table1),赶快有excel记录下来哦,别告诉其他人哦,一个基因就是一篇文章哦。

一般人,我不告诉他。。。,我只告诉二班的。。。

6.2.2 点突变和疼痛,找到2376文章,然后筛选基因哦(pain是比肿瘤、免疫、神经系统疾病、慢病更新的方向哦)

Trescot AM 2014  A review of the role of genetic testing in pain medicine. Pain Physician. 2014 Sep-Oct;17(5):425-45. Review. PMID:25247900

请看方法中的一段话哦,哇,好多基因与pain有关哦,猴哥还没有写哦,想写的同学们,快快行动哦,天下武功,唯快不破,你一定要比我快,比我幸福哦。。。。

 

6.3 跟随“大牛”脚步,筛选基因

6.3.1 韩国欧巴 Song GG 老师,检索一下他。。。

6.3.2 吓死宝宝,188篇

同学们试一下这个检索式:song gg[au] AND meta-analysis[tiab]

2016年4月份就有snpmeta 4篇哦

6.3.3 国内LI S 老师,检索一下。。。

6.3.4哇,305篇哦,2016年4月也有4篇哦。。。

 

6.4 总结

寻找靶基因:meta开始,点突变开始,大牛开始。

一个人的一生应该是这样度过的:当他回首往事的时候,他不会因为虚度年华而悔恨,也不会因为碌碌无为而羞耻;这样,在临死的时候,他就能够说:“我的整个生命和全部精力,都已经献给世界上最壮丽的事业——为人类的meta事业而斗争。

开始奋斗吧,少年。。。

 

拓展知识:

SNPmeta

SNPMETA1

SNPMETA2_检索式

SNPMETA3_索要原始文献+数据提取

 

教你如何做一篇meta分析1_

教你如何做一篇meta分析2_

教你如何做一篇meta分析3_哈温平衡的计算

教你如何做一篇meta分析4_NOS量表的制作

 

网状emta分析必备技能

网状emta分析必备技能1

网状meta分析必备技能2_R软件gemtc包

网状Meta分析必备技能3_数据初始值的设定

网状Meta分析必备技能4_Gemtc实现生存分析

网状meta分析必备技能5_HR风险比

网状meta分析必备技能6_R+Rstudio运用meta包做简单meta分析

网状meta分析必备技能7_使用R、GeMTC和STATA软件实现连续变量的网状Meta分析

 

网状meta分析stata简易教程

NMA(网状meta分析)stata简易教程(1)

NMA(网状meta分析)stata简易教程(2)网状图

NMA(网状meta分析)stata简易教程(3)贡献图

NMA(网状meta分析)stata简易教程(4)漏斗图的制作

NMA(网状meta分析)stata简易教程(5)排序图的制作

 

诊断性meta分析简单实现

诊断性meta分析简单实现(1)之revman

诊断性meta分析简单实现(2)

诊断性meta分析简单实现(3)

诊断性meta分析简单实现(4)_meta-disc

诊断性meta分析简单实现(5)_结果的展示和解读

 

其他

meta分析统计方法-随机对照试验的风险评估rob

生物标记物(基因)联合诊断模型的stata实现ROC(AUC)

生物标记物(基因)联合诊断模型的R实现ROC(AUC)

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