meta分析

教会大家如何做一篇meta1

大家好,我是“猴哥”。在这里,我用一盏茶的时间,一百个步骤,教会大家如何做一篇meta。

按总-分-总进行分步讲解,由表及里,由浅入深,由数据到程序,由视频到图表。先给大家来一段snpmeta,我边演示,大家觉得好就拍手,不好就拍砖。拍得越重,说明越是真感情。

  • SNPmeta分析系列

第一步:meta初体验

“我就看看,我不说话”。请大家先看一下视频,顺便看看“猴哥”是如何做meta的。

视频链接

怎么样,是不是相当地简单,我们也来一篇。。。

第二步:我爱你,meta

对于meta分析,地球人都知道。文章短平快,毕业晋升法宝。大仙喜欢,屌丝热爱,泡妞和转博之利器,居家必备之良药。我们越过PCR,穿过western,跨过奔腾的“组织细胞”,宽广美丽的meta正等着你。。。。。。

第三步:找个好老师

话说“师傅领进门,修行在个人”。如果有老师指点一下,或者和老师结伴而行做meta,一定会事半功倍。老师指点选题,老师指点检索,老师指点资料提取表,老师指点质量评价。。。带着做一篇,就全都会了啊。。。

基因多态性(SNP)的meta分析是最简单的meta分析。哪里简单了,“猴哥”,别瞎说。。。

第四步:SNPmeta分析最最最基础知识

4.1什么是SNP?

基因多态性是指在一个生物群体中,同时或经常存在两种或多种不连续的变异型或基因型或等位基因,包括DNA片段长度多态性、DNA重复序列多态性、单核苷酸多态性三类。单核苷酸多态性(single-nucleotide polymorphism,SNP)是最常见的一种,为散在的单个碱基的不同,包括单个碱基的插入、缺失以及置换,在患某疾病的人群中,出现一个频率较高的某等位基因或基因型SNP,则意味着此疾病的患病风险可能会增加。DNA中出现了叛徒,叛变了革命(置换),或换上了伪装,深入到敌后(插入),又或者是被敌人发现后杀害了(缺失),你这个叛徒。

4.2  SNPmeta分析能干些啥?

什么都能干。SNP可以是某个疾病的病因、危险因素,也可以做为肿瘤标记物、生物标记物诊断某疾病,也可以评估治疗效果,判断某个药物的不良反应,也可以判断某肿瘤的生存和预后。基本上,病因、诊断、治疗、预后四项全能冠军,所以写的人超多,不行,你看。

基因多态性检索式

Meta分析检索式

 

第五步 选个基因检索检索

5.1  以肿瘤学专业目前最最最火热的基因PD-1为例进行讲解,先走两步,走,走起。。。

5.2  PD-1的位点和真名,突变位点

5.3  PD-1真名是PDCD1,它的小名呢?--在gene里面找哦

以上就是前五步,选择基因,一定要根据自己的专业来选择哦,这样才能事半功倍。如果不会选择的话,那也好办,就像“超级女声”一样进行海选哦。如何海选呢,请看第六步 海选基因(超级女声)

 

拓展知识:

SNPmeta

SNPMETA1

SNPMETA2_检索式

SNPMETA3_索要原始文献+数据提取

 

教你如何做一篇meta分析1_

教你如何做一篇meta分析2_

教你如何做一篇meta分析3_哈温平衡的计算

教你如何做一篇meta分析4_NOS量表的制作

 

网状emta分析必备技能

网状emta分析必备技能1

网状meta分析必备技能2_R软件gemtc包

网状Meta分析必备技能3_数据初始值的设定

网状Meta分析必备技能4_Gemtc实现生存分析

网状meta分析必备技能5_HR风险比

网状meta分析必备技能6_R+Rstudio运用meta包做简单meta分析

网状meta分析必备技能7_使用R、GeMTC和STATA软件实现连续变量的网状Meta分析

 

网状meta分析stata简易教程

NMA(网状meta分析)stata简易教程(1)

NMA(网状meta分析)stata简易教程(2)网状图

NMA(网状meta分析)stata简易教程(3)贡献图

NMA(网状meta分析)stata简易教程(4)漏斗图的制作

NMA(网状meta分析)stata简易教程(5)排序图的制作

 

诊断性meta分析简单实现

诊断性meta分析简单实现(1)之revman

诊断性meta分析简单实现(2)

诊断性meta分析简单实现(3)

诊断性meta分析简单实现(4)_meta-disc

诊断性meta分析简单实现(5)_结果的展示和解读

 

其他

meta分析统计方法-随机对照试验的风险评估rob

生物标记物(基因)联合诊断模型的stata实现ROC(AUC)

生物标记物(基因)联合诊断模型的R实现ROC(AUC)

(1)

关键词:

热评文章

发表评论