meta分析

SNPmeta1

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第一卷  

第1章:亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)多态性与非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)之间的关联风险:meta分析

Man-Yi Sun, Li Zhang, Song-Li Shi, Jing-Na Lin

Published: April 29, 2016http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0154337

http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0154337

全文地址:

http://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0154337

 

#第一部分  摘要###########

背景

C677T和A1298C是亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)基因最常见的等位基因变体。MTHFR多态性与非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)发生之间的关联仍有争议。因此进行这项研究以检查MTHFR突变是否与NAFLD的易感性相关。

方法

通过Review Manager 5.0和Stata / SE 12.0软件对MTHFR多态性与NAFLD风险之间的关联进行了第一次Meta分析。搜索PubMed,EMBASE,CENTRAL,WOS,Scopus和EBSCOhost(2016年4月1 更新)的在线数据库进行合格的病例对照研究。通过Mantel-Haenszel统计学在随机或固定效应模型下计算(OR),95%置信区间(CI)和P值。

结果

8篇文章(785例和1188例对照)为目前的荟萃分析提供了数据。对于C677T,在纯合子模型(T / T vs C / C,OR = 1.49,95 %CI = 1.03〜2.15 ,P = 0.04)和隐性模型(T / T vs C / C)的病例组中观察到NAFLD风险增加+ C / T,OR = 1.42,95%CI = 1.07〜1.88,P = 0.02),而不是其他遗传学模型,与对照组比较。对于A1298C,等位基因模型检测到NAFLD风险显着升高(C vs A,OR = 1.53,95 %CI = 1.13〜2.07 ,P = 0.006),纯合子模型(C / C对A / A,OR = 2.81,95 %CI = 1.63〜4.85,P = 0.0002),显性模型(A / C + C / C对A / A,OR = 1.60,95 %CI = 1.06〜2.41 ,P = 0.03)和隐性模型对A / A + A / C,OR = 2.08,95%CI = 1.45〜3.00,

结论

MTHFR C677T多态性的T / T基因型和MTHFR A1298C的C / C基因型更可能与NAFLD的易感性相关。

 

###猴哥摘要解析:

  1. C677T和A1298C是亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)基因最常见的等位基因变体。MTHFR有2个突变位点,分别是 677位点C到T的突变; 1298 位点A到 C的突变。
  2. 软件:Review Manager 5.0和Stata / SE 12.0软件。其实本文可以只用stata12这一个软件实现。

3.检索数据库:PubMed,EMBASE,CENTRAL,WOS,Scopus和EBSCOhost(2016年4月1 更新)的在线数据库进行合格的病例对照研究

4.纳入研究:病例对照研究

5.统计学模型:固定、随机效应模型

6.SNPmeta分析模型:(见猴哥snpmeta分析系列)

7.结论:MTHFR C677T多态性的T / T基因型(突变子)和MTHFR A1298C的C / C基因型(突变子)更可能与NAFLD的易感性相关。这里强调的是突变子和可能。

 

#第二部分  文章整体流程###########

介绍

人类甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)基因位于染色体1p36.3并含有外显子11 [ 12 ]。作为一种叶酸代谢酶,通过催化5,10-亚甲基四氢叶酸不可逆还原成5-甲基四氢叶酸[ 3 - 6 ] ,MTHFR蛋白对同型半胱氨酸(Hcy)对甲硫氨酸的甲基化是必需的。MTHFR的结构或功能的异常可以参与同型半胱氨酸血症[发生5 - 7 ]。两个多态性变体,包括C677T(rs1801133)和A1298C(rs1801131),已经于MTHFR基因[被鉴定8 - 11 ]。

非酒精性脂肪肝病(NAFLD),最常见的慢性肝病,是代谢综合征的肝表现没有过量饮酒[史12 - 14 ]。NAFLD的肝脏病理主要由单纯性脂肪肝,非酒精性脂肪性肝炎(NASH),纤维化和肝硬化[的15 - 18 ]。纳什的特点是肝细胞损伤和炎症[ 15 - 18 ]。几个基因,例如patatin启动样磷脂酶结构域的3(PNPLA3),瘦素受体(LEPR)和MTHFR的多态性,据报道参与遗传易感性NAFLD [ 19 - 21 ]。对于MTHFR基因,报告关于其与NAFLD潜在相关矛盾的结果[ 22 - 30 ]。在这里,我们专注于人类MTHFR的多态性,并通过荟萃分析评估其与NAFLD风险的遗传相关性,荟萃分析是整合和分析来自不同研究的冲突数据的非常强大的工具[ 31 ]。

据我们所知,没有报道关于MTHFR遗传变异和NAFLD总体风险关联的荟萃分析。因此,我们首先进行荟萃分析来调查MTHFR多态性(C677T和A1298C)与NAFLD易感性之间的关系。我们的发现显示,MTHFR基因的C677T和A1298C多态性可能与NAFLD的风险呈正相关。

###猴哥前言解析:

第一段:1浅谈基因和突变。Mthfr的重要性。

第二段:1介绍脂肪肝的重要性。2和遗传相关。3 mthfr 和脂肪肝的简单联系。

第三段:1强调没有报道。2我们首先写这篇文章。

 

拓展知识:

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