meta分析

网状meta必备技能1-从网页获取数据

第一卷  网状meta基本技能

第1章:从网页获取数据,“我要爬一下数据”

大家好,我是猴哥   O(∩_∩)O~,今天主要讲网状meta分析的基本概念和从网页获取数据,在同学们多次问到网状meta分析的基础知识后,猴哥终于决定出绝招了。。。。。。

在这里想要教会大家如何做一篇网状meta分析,不知道你们准备好了没有。。。

普通meta的基础知识,请大家看龙哥的教程,猴哥在此不表。。。

传统meta分析的问题如下:(治疗方案太多,我们已经无从比较和选择)

1.1网状meta分析的概念:

网状meta分析的定义: 基于间接比较或间接比较与直接比较合并结果同时分析 2 个以上干预措施的 Meta分析。 包括如下 2 种情况:

①调整间接比较 Meta分析:当不存在直接比较情况下,基于共同对照对多个干预措施进行比较的 Meta分析;

②混合治疗效应 Meta分析:当同时存在直接比较和间接比较的情况下,基于间接结果或间接结果与直接结果的合并结果同时分析多个干预措施的 Meta分析。

2002年,Lumley 等提出了网状 Meta 分析

 

1.2网状meta分析的简单检索式

"network meta analysis" OR "network meta analyses" OR "mixed treatment comparison meta analysis" OR "mixed treatment comparisons meta analyses"

将上述检索式按主题词+自由词+组合词进行分解和合并后得到详细检索式如下:

放入到pubmed框中,我们得到4851篇文献

1.3  NMA方法学的三个关键假设

在做网状meta分析之前,我们默认我们的研究是同质的(都是本科生。。。),默认试验是相似的(都用安卓手机或者苹果手机。。。),默认证据是一致的(都认为钓鱼岛是中国的。。。),有了这三个前提,我们开始我们中国人最擅长的“网状”关系。。。你懂的。。。

其余的和一般的meta分析类似。。。

1.4  从网页获取数据

在完成选题ideas,可以复习一下之前的教程

1.4.1 一盏茶一篇meta(一)-- meta分析命令操作,统计学只是工具而已啊。。。链接如下:

 

1.4.2 一盏茶一篇meta(二)—SNP系列,检索式,告诉如何检索

 

1.4.3 一盏茶一篇meta(三)—告诉如何选题

 

1.4.4 SNP Meta(四)—数据库寻找靶基因—告诉如何查找数据库

 

1.4.5一盏茶一篇meta(五)之实战:基本流程--告诉如何导入文献

 

1.4.6 如何从网页中获取所需数据(批量获取)

1.4.6.1 首先我们要安装 R软件和RStudio软件

猴哥提供了百度盘下载链接,R软件windows版和mac版,RStudio软件,具体安装方法,请百度之。Stata13.1版本,内附安装视频,请大家学习。

1.4.6.2 现公开代码和演示

①安装好r软件和rstudio,打开RStudio,见到如下窗口

② 执行如下命令

原文网址如下:

http://bmcmedresmethodol.biomedcentral.com/articles/10.1186/1471-2288-11-61

DOI: 10.1186/1471-2288-11-61       PMID: 21548941

里面有我们需要做网状meta分析的数据和结果,共4个table

③继续输入如下命令

④最后保存到rwork文件夹中的tbls1 2 3 4.csv文件夹

⑤获取到表格Table1等,如下图所示

 

拓展知识:

SNPmeta

SNPMETA1

SNPMETA2_检索式

SNPMETA3_索要原始文献+数据提取

 

教你如何做一篇meta分析1_

教你如何做一篇meta分析2_

教你如何做一篇meta分析3_哈温平衡的计算

教你如何做一篇meta分析4_NOS量表的制作

 

网状emta分析必备技能

网状emta分析必备技能1

网状meta分析必备技能2_R软件gemtc包

网状Meta分析必备技能3_数据初始值的设定

网状Meta分析必备技能4_Gemtc实现生存分析

网状meta分析必备技能5_HR风险比

网状meta分析必备技能6_R+Rstudio运用meta包做简单meta分析

网状meta分析必备技能7_使用R、GeMTC和STATA软件实现连续变量的网状Meta分析

 

网状meta分析stata简易教程

NMA(网状meta分析)stata简易教程(1)

NMA(网状meta分析)stata简易教程(2)网状图

NMA(网状meta分析)stata简易教程(3)贡献图

NMA(网状meta分析)stata简易教程(4)漏斗图的制作

NMA(网状meta分析)stata简易教程(5)排序图的制作

 

诊断性meta分析简单实现

诊断性meta分析简单实现(1)之revman

诊断性meta分析简单实现(2)

诊断性meta分析简单实现(3)

诊断性meta分析简单实现(4)_meta-disc

诊断性meta分析简单实现(5)_结果的展示和解读

 

其他

meta分析统计方法-随机对照试验的风险评估rob

生物标记物(基因)联合诊断模型的stata实现ROC(AUC)

生物标记物(基因)联合诊断模型的R实现ROC(AUC)

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